I 1989 blev havnen udvidet med en decideret lystbådehavn. Agersø Lystbådehavn har ca. 25 fastliggende lyst-både, plads til ca. 80 større både, og sejlerne har dannet deres eget »Agersø Bådelaug« med laugets stander på havnens flagspil, samt sejlerstue med TV og opholdsmuligheder ved dårligt vejr.